Komise mládeže (KM) prosazuje poslání ČMFS, které spočívá ve snaze vést mládež k
pozitivním občanským postojům, zdravému způsobu života a zabraňovat tomu, aby se
mládež stávala závislá na alkoholu nebo drogách, a to zejména:
- propagací mládežnického fotbalu v rámci kraje,
- organizováním meziokresních soutěží výběrů jednotlivých OFS,
- organizováním turnaje „O pohár předsedy JmKFS“ pro žákovská družstva v působnosti
JmKFS a OFS příslušejících k JmKFS,
- zajištěním podmínek pro řádné fungování krajských výběrů třináctiletých a čtrnáctiletých
žáků a jejich účasti v celorepublikové mezikrajské soutěži,
- pořádáním mládežnických turnajů.
Členové KM mimo jiné navštěvují mládežnická utkání v působnosti JmKFS s cílem zamezit
neoprávněným startům hráčů (k prosazení tohoto cíle jsou zpracovány prováděcí pokyny
kontrol zaměřených na zamezení neoprávněných startů hráčů v mládežnických družstvech).